http://ecobio.univ-rennes1.fr/ Site de présentation de l'unité de Recherches UMR 6553 Ecobio fr-fr © 1996 - 2012 CNRS-UMR 6553 Ecobio- Mentions légales - Olivier.Troccaz@nospam.com (OTroccaz) Olivier.Troccaz@nospam.com (OTroccaz) Thu, 17 May 2012 02:57:22 +0200 Thu, 17 May 2012 02:57:22 +0200 http://backend.userland.com/rss e107 (http://e107.org) hourly 1 60 http://ecobio.univ-rennes1.fr/images/logo_ecobio.jpg http://ecobio.univ-rennes1.fr/ 88 31 Site de présentation de l'unité de Recherches UMR 6553 Ecobio http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.99.1 Nouveau : Recrutement d'un professeur en Ecologie Intégrative - New : full-time permanent professor position in Integrative Ecology
]]> Nouveau : Recrutement d'un professeur en Ecologie Intégrative - New : full-time permanent professor position in Integrative Ecology
]]> Divers Olivier Troccaz Mon, 31 Dec 2012 10:00:00 +0100 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.99.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.186.1 Du 2 au 6 juillet 2012, à Bari, Italie.


Ecosystem services and functions driven by the diversity of soil biota (S11.3)


Dans le cadre du 4ème congrès européen EUROSOIL, Guénola PERES organise en collaboration avec Martin POTTOFF (University of Göttingen, Allemagne), Johann ZALLER (University of Natural Resources and Life Sciences Vienna, Autriche) et Ciro GARDI (European Commission - Joint Research Centre Ispra - Italie) un symposium intitulé "Ecosystem services and functions driven by the diversity of soil biota (S11.3)"

Voici quelques éléments d'appréciation sur ce topic

Toutes les personnes intéressées par le sujet sont invitées à soumettre leur résumé pour le 10 Octobre 2011 sur le site dédié au colloque EUROSOIL

Contact : Guénola PERES
]]> Du 2 au 6 juillet 2012, à Bari, Italie.


Ecosystem services and functions driven by the diversity of soil biota (S11.3)


Dans le cadre du 4ème congrès européen EUROSOIL, Guénola PERES organise en collaboration avec Martin POTTOFF (University of Göttingen, Allemagne), Johann ZALLER (University of Natural Resources and Life Sciences Vienna, Autriche) et Ciro GARDI (European Commission - Joint Research Centre Ispra - Italie) un symposium intitulé "Ecosystem services and functions driven by the diversity of soil biota (S11.3)"

Voici quelques éléments d'appréciation sur ce topic

Toutes les personnes intéressées par le sujet sont invitées à soumettre leur résumé pour le 10 Octobre 2011 sur le site dédié au colloque EUROSOIL

Contact : Guénola PERES
]]> Divers Olivier Troccaz Fri, 06 Jul 2012 10:28:30 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.186.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.212.1 Le mercredi 30 mai, à 9h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, campus de Beaulieu, UR1.
Diversité des branches évolutives basales du règne des Champignons dans les écosystèmes hydrothermaux marins profonds.

Jury :
Laure GUILLOU, Directeur de recherche, UMR 7144, Roscoff / Rapporteur
Sébastien DUPERRON, Maître de conférence, UMR 7138, Université Pierre et Marie Curie, Paris / Rapporteur
Marc-André SELOSSE, Professeur, UMR 5175, Université de Montpellier 2 / Examinateur
Théodore BOUCHEZ, Chercheur à Irstea-Antony / Examinateur
Georges BARBIER, Professeur, ESMISAB Brest / Examinateur
Philippe VANDENKOORNHUYSE, Professeur, UMR 6553, Université de Rennes 1 / Directeur de thèse

Résumé :
Les champignons sont des organismes hétérotrophes ubiquistes qui jouent des rôles pivots dans de nombreux écosystèmes (e.g. décomposeurs, symbiontes) et qui forment une des principales lignées eucaryotes. Les Chytridiomycota constituent les branches basales du règne des Champignons, une position critique pour la compréhension de la radiation évolutive fongique. Or, ce groupe a très peu été étudié, laissant les racines évolutives du règne des Champignons non résolues. Ici, nous décrivons la diversité fongique, en ciblant principalement les Chytridiomycota via des analyses de génomique environnementale. Des échantillons de diverses natures ont été collectés au niveau de sources hydrothermales marines profondes. Celles-ci sont connues pour être des hotspots de diversité avec un fort taux d'endémisme. Pour l'analyse des séquences moléculaires obtenues, une base de données (PHYMYCO-DB) portant sur des marqueurs moléculaires fiables dédiés à la phylogénie fongique, a été créée puis mise en ligne. Des outils développés au cours de cette thèse ont permis de récupérer six phylotypes Chytridiomycota dont quatre produisant des branches non-décrites à ce jour. De plus, la diversité obtenue dépasse le clade des Opisthokonta (i.e. qui contient principalement les règnes des Animaux et des Champignons) : un phylotype Apusozoa et deux autres phylotypes ayant une position indéfinie mais antérieure aux Unikonta connus. Ces résultats offrent des perspectives pour la description de nouveaux organismes via le séquençage de génomes ou l'imagerie. Ces organismes sont également prometteurs pour la résolution des relations évolutives chez les Opisthokonta, les Unikonta, voire les Bikonta.


Contact : Stéphane MAHE

]]> Le mercredi 30 mai, à 9h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, campus de Beaulieu, UR1.
Diversité des branches évolutives basales du règne des Champignons dans les écosystèmes hydrothermaux marins profonds.

Jury :
Laure GUILLOU, Directeur de recherche, UMR 7144, Roscoff / Rapporteur
Sébastien DUPERRON, Maître de conférence, UMR 7138, Université Pierre et Marie Curie, Paris / Rapporteur
Marc-André SELOSSE, Professeur, UMR 5175, Université de Montpellier 2 / Examinateur
Théodore BOUCHEZ, Chercheur à Irstea-Antony / Examinateur
Georges BARBIER, Professeur, ESMISAB Brest / Examinateur
Philippe VANDENKOORNHUYSE, Professeur, UMR 6553, Université de Rennes 1 / Directeur de thèse

Résumé :
Les champignons sont des organismes hétérotrophes ubiquistes qui jouent des rôles pivots dans de nombreux écosystèmes (e.g. décomposeurs, symbiontes) et qui forment une des principales lignées eucaryotes. Les Chytridiomycota constituent les branches basales du règne des Champignons, une position critique pour la compréhension de la radiation évolutive fongique. Or, ce groupe a très peu été étudié, laissant les racines évolutives du règne des Champignons non résolues. Ici, nous décrivons la diversité fongique, en ciblant principalement les Chytridiomycota via des analyses de génomique environnementale. Des échantillons de diverses natures ont été collectés au niveau de sources hydrothermales marines profondes. Celles-ci sont connues pour être des hotspots de diversité avec un fort taux d'endémisme. Pour l'analyse des séquences moléculaires obtenues, une base de données (PHYMYCO-DB) portant sur des marqueurs moléculaires fiables dédiés à la phylogénie fongique, a été créée puis mise en ligne. Des outils développés au cours de cette thèse ont permis de récupérer six phylotypes Chytridiomycota dont quatre produisant des branches non-décrites à ce jour. De plus, la diversité obtenue dépasse le clade des Opisthokonta (i.e. qui contient principalement les règnes des Animaux et des Champignons) : un phylotype Apusozoa et deux autres phylotypes ayant une position indéfinie mais antérieure aux Unikonta connus. Ces résultats offrent des perspectives pour la description de nouveaux organismes via le séquençage de génomes ou l'imagerie. Ces organismes sont également prometteurs pour la résolution des relations évolutives chez les Opisthokonta, les Unikonta, voire les Bikonta.


Contact : Stéphane MAHE

]]> Divers Olivier Troccaz Wed, 30 May 2012 09:30:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.212.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.213.1 Le mrecredi 16 mai, à 11h00, salle des thèses, campus de Beaulieu, UR1.


Evolution in polyploid plants: lessons from cotton



Le Professseur Wendel est connu pour ses travaux concernant l'évolution du génome, la phylogénie, l'expression des gènes chez le coton. Il a réalisé ces dernières années de nombreux travaux qui font aujourd'hui référence dans le domaine de la génomique évolutive.

Contact : Jonathan F WENDEL
]]> Le mrecredi 16 mai, à 11h00, salle des thèses, campus de Beaulieu, UR1.


Evolution in polyploid plants: lessons from cotton



Le Professseur Wendel est connu pour ses travaux concernant l'évolution du génome, la phylogénie, l'expression des gènes chez le coton. Il a réalisé ces dernières années de nombreux travaux qui font aujourd'hui référence dans le domaine de la génomique évolutive.

Contact : Jonathan F WENDEL
]]> Divers Olivier Troccaz Wed, 16 May 2012 11:00:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.213.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.211.1 Le vendredi 4 mai, à 12h45, salle de réunion UFR SVE, bâtiment 13, campus de Beaulieu, UR1.


Les nouveaux défis de la bioinformatique & le rôle de la plateforme GenOuest de Rennes

Cette conférence est proposée dans le cadre des animations de l'axe fédérateur génomique environnementale et évolutive

Durant cet exposé, je présenterai la plateforme bioinformatique GenOuest, son offre de service et les différents projets de développement qu'elle porte. A partir de l'angle de vue d'une plate-forme, les différents défis que doit relever la Biologie seront évoqués: calcul, données, nouveaux modes de travail, ainsi que leur impacts en Biologie et en Ecologie


Contact : Olivier COLLIN
]]> Le vendredi 4 mai, à 12h45, salle de réunion UFR SVE, bâtiment 13, campus de Beaulieu, UR1.


Les nouveaux défis de la bioinformatique & le rôle de la plateforme GenOuest de Rennes

Cette conférence est proposée dans le cadre des animations de l'axe fédérateur génomique environnementale et évolutive

Durant cet exposé, je présenterai la plateforme bioinformatique GenOuest, son offre de service et les différents projets de développement qu'elle porte. A partir de l'angle de vue d'une plate-forme, les différents défis que doit relever la Biologie seront évoqués: calcul, données, nouveaux modes de travail, ainsi que leur impacts en Biologie et en Ecologie


Contact : Olivier COLLIN
]]> Divers Olivier Troccaz Fri, 04 May 2012 12:00:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.211.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.210.1 Le vendredi 27 avril, à 13h15, salle de conférences de l'OSUR, campus de Beaulieu, UR1.


Quelle est la dynamique évolutive de nos écosystèmes ?



Résumé :
Quelle est la dynamique évolutive de nos écosystèmes ? Pour l'instant on ne le sait pas. Mais on sait que la coexistence entre les espèces et le fonctionnement écosystémique dépendent des traits. Ces traits ont une dynamique évolutive. Actuellement, ces traits changent en réponse à la coexistence locale. Récemment un accident génomique (hybridation) a créé des nouveaux traits. Depuis des millions d'années des lignées maintiennent leurs traits. La coexistence locale et le fonctionnement écosystémique sont donc contrôlés par la sélection actuelle et/ou par l'évolution neutre récente et/ou par l'évolution ancienne. On a donc tous les éléments pour étudier la dynamique évolutive de nos écosystèmes. Dans quelles situations est-ce qu'on s'attend à une dynamique évolutive des communautés et écosystèmes plutôt actuelle, plutôt récente ou plutôt ancien? Quelles en sont les conséquences, par exemple pour la stabilité ou pour la résilience des communautés et écosystèmes face aux changements environnementaux ?

Contact : Anne ATLAN
]]> Le vendredi 27 avril, à 13h15, salle de conférences de l'OSUR, campus de Beaulieu, UR1.


Quelle est la dynamique évolutive de nos écosystèmes ?



Résumé :
Quelle est la dynamique évolutive de nos écosystèmes ? Pour l'instant on ne le sait pas. Mais on sait que la coexistence entre les espèces et le fonctionnement écosystémique dépendent des traits. Ces traits ont une dynamique évolutive. Actuellement, ces traits changent en réponse à la coexistence locale. Récemment un accident génomique (hybridation) a créé des nouveaux traits. Depuis des millions d'années des lignées maintiennent leurs traits. La coexistence locale et le fonctionnement écosystémique sont donc contrôlés par la sélection actuelle et/ou par l'évolution neutre récente et/ou par l'évolution ancienne. On a donc tous les éléments pour étudier la dynamique évolutive de nos écosystèmes. Dans quelles situations est-ce qu'on s'attend à une dynamique évolutive des communautés et écosystèmes plutôt actuelle, plutôt récente ou plutôt ancien? Quelles en sont les conséquences, par exemple pour la stabilité ou pour la résilience des communautés et écosystèmes face aux changements environnementaux ?

Contact : Anne ATLAN
]]> Divers Olivier Troccaz Fri, 27 Apr 2012 12:45:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.210.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.203.1 Le mardi 24 avril, à 20h30, à l'Espace des sciences aux Champs Libres à Rennes.


Dynamique de la biodiversité : ça déménage chez les chauves-souris !


Présentation :
Au cœur des phénomènes de spéciation et des problématiques d’extinction, la dispersion, qui représente la capacité des organismes à changer de lieu de vie, est un paramètre clé comme nous le démontre la biologie des chauves-souris. Elles représentent le second ordre le plus riche en espèces chez les Mammifères (derrière les Rongeurs), mais partagent aussi avec leurs congénères à poils (et les autres) quelques problèmes de survie dans un monde fortement perturbé par les activités humaines.

Programme complet sur le site de l'Espace des sciences

Infos pratiques
Entrée libre (dans la limite des places disponibles)

Réservation conseillée au 02 23 40 66 00
Des places sont disponibles chaque mardi, sans réservation (à retirer à la billetterie à partir de 19h30)


Contact : Eric PETIT
]]> Le mardi 24 avril, à 20h30, à l'Espace des sciences aux Champs Libres à Rennes.


Dynamique de la biodiversité : ça déménage chez les chauves-souris !


Présentation :
Au cœur des phénomènes de spéciation et des problématiques d’extinction, la dispersion, qui représente la capacité des organismes à changer de lieu de vie, est un paramètre clé comme nous le démontre la biologie des chauves-souris. Elles représentent le second ordre le plus riche en espèces chez les Mammifères (derrière les Rongeurs), mais partagent aussi avec leurs congénères à poils (et les autres) quelques problèmes de survie dans un monde fortement perturbé par les activités humaines.

Programme complet sur le site de l'Espace des sciences

Infos pratiques
Entrée libre (dans la limite des places disponibles)

Réservation conseillée au 02 23 40 66 00
Des places sont disponibles chaque mardi, sans réservation (à retirer à la billetterie à partir de 19h30)


Contact : Eric PETIT
]]> Divers Olivier Troccaz Tue, 24 Apr 2012 20:30:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.203.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.208.1 Le vendredi 6 avril, à 12h45, salle de conférences de l'OSUR, campus de Beaulieu, UR1.

Apport de l'immunoécologie dans les interactions tritrophiques : la vigne, les vers de la grappe et les parasitoïdes associés

Résumé :
Lors des interactions tri-trophiques liant une plante hôte, ses phytophages et leurs ennemis naturels dont les parasitoïdes, chaque niveau trophique est fortement dépendant des autres. Lorsque qu’un ennemi naturel de type microorganisme, nématode ou parasitoïde attaque le phytophage, le seul moyen de défense est le système immunitaire. Encore peu d’études font réellement le lien entre les interactions tritrophiques et les défenses immunitaires des phytophages.
Notre travail cherche à tester l’influence de la variation des différents cépages de vigne sur les traits d’histoires de vie d’un des principaux ravageurs de cette culture (l’eudémis de la vigne) et les répercussions sur les parasitoïdes qui exploitent ce ravageur. Nous recherchons également si le système immunitaire des phytophages peut être dépendant de la qualité du
cépage et si au final il peut jouer le rôle d’arbitre dans ces interactions tritrophiques.
Au cours de cette présentation, je montrerai les principaux résultats obtenus au cours de ces dernières années.


Contact : Jérôme MOREAU
]]> Le vendredi 6 avril, à 12h45, salle de conférences de l'OSUR, campus de Beaulieu, UR1.

Apport de l'immunoécologie dans les interactions tritrophiques : la vigne, les vers de la grappe et les parasitoïdes associés

Résumé :
Lors des interactions tri-trophiques liant une plante hôte, ses phytophages et leurs ennemis naturels dont les parasitoïdes, chaque niveau trophique est fortement dépendant des autres. Lorsque qu’un ennemi naturel de type microorganisme, nématode ou parasitoïde attaque le phytophage, le seul moyen de défense est le système immunitaire. Encore peu d’études font réellement le lien entre les interactions tritrophiques et les défenses immunitaires des phytophages.
Notre travail cherche à tester l’influence de la variation des différents cépages de vigne sur les traits d’histoires de vie d’un des principaux ravageurs de cette culture (l’eudémis de la vigne) et les répercussions sur les parasitoïdes qui exploitent ce ravageur. Nous recherchons également si le système immunitaire des phytophages peut être dépendant de la qualité du
cépage et si au final il peut jouer le rôle d’arbitre dans ces interactions tritrophiques.
Au cours de cette présentation, je montrerai les principaux résultats obtenus au cours de ces dernières années.


Contact : Jérôme MOREAU
]]> Divers Olivier Troccaz Fri, 06 Apr 2012 12:45:00 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.208.1 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.209.1 Le lundi 2 avril, à 14h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, campus de Beaulieu, UR1.
La clonalité : un processus majeur de la dynamique spatiale et du fonctionnement des communautés végétales en systèmes prairiaux.

Jury :
Tomáš HERBEN, Professor, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic, Rapporteur
François GILLET, Professeur, UMR 6249, Université de Franche-Comté, Rapporteur
Deborah GOLDBERG, Professor and Chair, Ecology and Evolutionary Biology, University of Michigan, Examinateur
Sara PUIJALON, Chargée de Recherche, UMR 5023, Université de Lyon 1, Examinateur
Bernard CLEMENT, Maître de Conférences, UMR 6553, Université de Rennes 1, Directeur de thèse
Cendrine MONY, Maître de Conférences, UMR 6553, Université de Rennes 1, Co-directeur de thèse


Résumé :
La dispersion par croissance clonale serait un processus majeur de la structuration des communautés végétales, particulièrement en prairies où une majorité d’espèces sont clonales. Celles-ci produisent des modules génétiquement identiques organisés en réseau, dont l’agrégation dépend de la stratégie de croissance de l’espèce. Cette thèse vise à analyser et à comprendre la dynamique des communautés végétales de prairie en se basant sur les règles d’assemblage spatial des espèces clonales et d’en déterminer les conséquences pour leur fonctionnement. Pour cela, des approches complémentaires expérimentales et de modélisation ont été utilisées. Nos résultats montrent que les stratégies de croissance des clones déterminent la structure spatiale des communautés à échelle fine, générant un large panel de patrons. Le patron spatial d’une espèce varie selon les stratégies de croissance clonale présentes dans la communauté. Ces variations résulteraient d’une modification des traits clonaux en réponse à l’environnement biotique. Le clone est capable d’ajuster sa croissance horizontale selon l’identité de son compétiteur grâce aux informations collectées par les modules. La valeur adaptative de cette réponse plastique dans la résistance à la compétition dépend du structural blue-print de la plante mais peu de l’ontogénie. Nous montrons également que les traits clonaux ont un rôle majeur dans le fonctionnement des communautés en influençant leur productivité, probablement via les patrons spatiaux qu’ils génèrent. Ces résultats ont été utilisés dans le cadre de la mise en place des bandes enherbées, afin de définir un semis optimal par rapport à leur fonction de préservation de la qualité de l’eau. Ce travail souligne l’importance des processus observés à l’échelle du clone pour ceux opérant à l’échelle de la communauté ou de l’écosystème.


Mots-clés :
Bande enherbée ; Mésocosmes ; Modèles Individu Centré ; Patrons spatiaux ; Plasticité ; Stratégies de croissance ; Traits clonaux


Contact : Anne-Kristel BITTEBIERE

]]> Le lundi 2 avril, à 14h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, campus de Beaulieu, UR1.
La clonalité : un processus majeur de la dynamique spatiale et du fonctionnement des communautés végétales en systèmes prairiaux.

Jury :
Tomáš HERBEN, Professor, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic, Rapporteur
François GILLET, Professeur, UMR 6249, Université de Franche-Comté, Rapporteur
Deborah GOLDBERG, Professor and Chair, Ecology and Evolutionary Biology, University of Michigan, Examinateur
Sara PUIJALON, Chargée de Recherche, UMR 5023, Université de Lyon 1, Examinateur
Bernard CLEMENT, Maître de Conférences, UMR 6553, Université de Rennes 1, Directeur de thèse
Cendrine MONY, Maître de Conférences, UMR 6553, Université de Rennes 1, Co-directeur de thèse


Résumé :
La dispersion par croissance clonale serait un processus majeur de la structuration des communautés végétales, particulièrement en prairies où une majorité d’espèces sont clonales. Celles-ci produisent des modules génétiquement identiques organisés en réseau, dont l’agrégation dépend de la stratégie de croissance de l’espèce. Cette thèse vise à analyser et à comprendre la dynamique des communautés végétales de prairie en se basant sur les règles d’assemblage spatial des espèces clonales et d’en déterminer les conséquences pour leur fonctionnement. Pour cela, des approches complémentaires expérimentales et de modélisation ont été utilisées. Nos résultats montrent que les stratégies de croissance des clones déterminent la structure spatiale des communautés à échelle fine, générant un large panel de patrons. Le patron spatial d’une espèce varie selon les stratégies de croissance clonale présentes dans la communauté. Ces variations résulteraient d’une modification des traits clonaux en réponse à l’environnement biotique. Le clone est capable d’ajuster sa croissance horizontale selon l’identité de son compétiteur grâce aux informations collectées par les modules. La valeur adaptative de cette réponse plastique dans la résistance à la compétition dépend du structural blue-print de la plante mais peu de l’ontogénie. Nous montrons également que les traits clonaux ont un rôle majeur dans le fonctionnement des communautés en influençant leur productivité, probablement via les patrons spatiaux qu’ils génèrent. Ces résultats ont été utilisés dans le cadre de la mise en place des bandes enherbées, afin de définir un semis optimal par rapport à leur fonction de préservation de la qualité de l’eau. Ce travail souligne l’importance des processus observés à l’échelle du clone pour ceux opérant à l’échelle de la communauté ou de l’écosystème.


Mots-clés :
Bande enherbée ; Mésocosmes ; Modèles Individu Centré ; Patrons spatiaux ; Plasticité ; Stratégies de croissance ; Traits clonaux


Contact : Anne-Kristel BITTEBIERE

]]> Divers Olivier Troccaz Mon, 02 Apr 2012 14:30:30 +0200 http://ecobio.univ-rennes1.fr/news.php?item.209.1