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Articles

1 - 
A. Cavé-Radet, A. Salmon, O. Lima, M. Ainouche, A. El Amrani - 
Increased tolerance to organic xenobiotics following recent allopolyploidy in Spartina (Poaceae) - 
Plant Science, Elsevier, 2019, 280, pp.143-154.  - 
DOI : https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.11.005 - 
Pubmed : 30823992 - 
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2 - 
A. Cavé-Radet, D. Giraud, O. Lima, A. El Amrani, M. Ainouche, A. Salmon - 
Evolution of small RNA expression following hybridization and allopolyploidization insights from Spartina species (Poaceae, Chloridoideae) - 
Plant Molecular Biology, 2019 - 
DOI : https://doi.org/10.1007/s11103-019-00931-w - 
Pubmed : 31748889 - 
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3 - 
B. Gallego-Tévar, B. Grewell, H. Rousseau, J. Keller, A. Aïnouche, O. Lima, S. Dréano, A. Salmon, E. Figueroa, M. Ainouche, J. M. Castillo - 
Genetic structure of Spartina hybrids between native Spartina maritima and invasive Spartina densiflora in Southwest Europe - 
Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, Elsevier, 2019, 37, pp.26-38.  - 
DOI : https://doi.org/10.1016/j.ppees.2019.02.001 - 
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4 - 
J. Castillo, S. Dréano, J. Castillo, B. Gallego-Tévar, E. Figueroa, B. Grewell, D. Vallet, H. Rousseau, J. Keller, O. Lima, S. Dréano, A. Salmon, M. Ainouche - 
Low genetic diversity contrasts with high phenotypic variability in heptaploid Spartina densiflora populations invading the Pacific coast of North America - 
Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2018, 8 (10), pp.4992-5007.  - 
DOI : https://doi.org/10.1002/ece3.4063 - 
Pubmed : 29876076 - 
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5 - 
J. Keller, J. Imperial, T. Ruiz-Argüeso, K. Privet, O. Lima, S. Michon-Coudouel, M. Biget, A. Salmon, A. Aïnouche, F. Cabello-Hurtado - 
RNA sequencing and analysis of three Lupinus nodulomes provide new insights into specific host-symbiont relationships with compatible and incompatible Bradyrhizobium strains - 
Plant Science, Elsevier, 2018, 266, pp.102-116.  - 
DOI : https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2017.10.015 - 
Pubmed : 29241560 - 
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6 - 
J. Boutte, B. Aliaga, O. Lima, Julie Ferreira De Carvalho, A. Aïnouche, J. Macas, M. Rousseau-Gueutin, O. Coriton, M. Ainouche, A. Salmon - 
Haplotype Detection from Next-Generation Sequencing in High-Ploidy-Level Species: 45S rDNA Gene Copies in the Hexaploid Spartina maritima - 
G3, Genetics Society of America, 2016, 6 (1), pp.29--40.  - 
DOI : https://doi.org/10.1534/g3.115.023242 - 
Pubmed : 26530424 - 
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7 - 
P. Bonin, C. Vieira, R. Grimaud, C. Militon, P. Cuny, O. Lima, S. Guasco, Corina P D Brussaard, V. Michotey - 
Substrates specialization in lipid compounds and hydrocarbons of Marinobacter genus. - 
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22, pp.15347-15359.  - 
DOI : https://doi.org/10.1007/s11356-014-4009-y - 
Pubmed : 25561256 - 
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8 - 
M. Rousseau-Gueutin, S. Bellot, G. E. Martin, J. Boutte, H. Chelaifa, O. Lima, S. Michon-Coudouel, D. Naquin, A. Salmon, A. Ainouche, M. L. Ainouche - 
The chloroplast genome of the hexaploid Spartina maritima (Poaceae, Chloridoideae): Comparative analyses and molecular dating - 
Molecular Phylogenetics and Evolution, Elsevier, 2015, 93, pp.5-16.  - 
DOI : https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.06.013 - 
Pubmed : 26182838 - 
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9 - 
G. E. Martin, M. Rousseau-Gueutin, S. Cordonnier, O. Lima, S. Michon-Coudouel, D. Naquin, J. Ferreira de Carvalho, M. L. Aïnouche, A. Salmon, A. Aïnouche - 
The first complete chloroplast genome of the Genistoid legume Lupinus luteus: evidence for a novel major lineage-specific rearrangement and new insights regarding plastome evolution in the legume family - 
Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2014, 113 (7), pp.1197-1210.  - 
DOI : https://doi.org/10.1093/aob/mcu050 - 
Pubmed : 24769537 - 
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Communications

10 - 
M. L. Ainouche, D. Giraud, A. Cavé-Radet, J. Boutte, O. Lima, O. Coriton, V. Huteau, M. Rousseau-Gueutin, A. E. Amrani, C. Richards, A. Salmon - 
Spartina alterniflora genome evolution and gene expression under stress (pollution) conditions - 
International Symposium on Spartina alterniflora: Dispersion, Control and Utilization, East China Normal University, Oct 2019, Shanghai, China.  - 
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11 - 
A. Cavé-Radet, L. T. V. Canh, D. Giraud, O. Lima, M. L. Aïnouche, A. Salmon, A. E. Amrani - 
Micro-RNAs and tolerance to environmental organic pollutants in polyploid Spartina - 
Workshop DYNAGEV2018, Jun 2018, Rennes, France.  - 
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12 - 
D. Giraud, A. Cavé-Radet, B. Thamphya, O. Lima, V. Huteau, O. Coriton, A. E. Amrani, M. L. Aïnouche, A. Salmon - 
Evolutionary dynamics of repeated sequences in polyploid Spartina species - 
Workshop DYNAGEV2018, Jun 2018, Rennes, France.  - 
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13 - 
D. Giraud, A. Cavé-Radet, O. Lima, V. Huteau, O. Coriton, A. E. Amrani, M. L. Ainouche, A. Salmon - 
Evolutionary dynamics of repeated sequences in polyploid Spartina species - 
SFEcologie2018 International Conference on Ecological Sciences, SFEcologie, Oct 2018, Rennes, France.  - 
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14 - 
M. L. Aïnouche, A. Cavé-Radet, D. Giraud, A. Baumel, B. Gallego-Tévar, J. Castillo, M. Rousseau-Gueutin, J. Boutte, Julie Ferreira De Carvalho, O. Lima, A. Kovarick, A. R. Leitch, I. J. Leitch, A. Ainouche, F. Cabello-Hurtado, A. E. Amrani, A. Salmon - 
Genome merger and duplication as springboards for plant invasion: Lessons from Spartina - 
International Conference on Ecological Sciences, SFEcologie2018, SFEcologie, Oct 2018, Rennes, France.  - 
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15 - 
A. Salmon, A. Cavé-Radet, D. Giraud, J. Boutte, H. Rousseau, O. Lima, M. Rousseau-Gueutin, A. E. Amrani, M. L. Ainouche - 
New traits in Spartina species: A consequence of hybridizations and/or polyploidy? - 
PAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States.  - 
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16 - 
A. Salmon, A. Cavé-Radet, D. Giraud, J. Boutte, O. Lima, M. Rousseau-Gueutin, A. E. Amrani, M. L. Ainouche - 
Epigenetics and stress tolerance in polyploid Spartina (Poaceae) - 
SFEcologie2018 International Conference on Ecological Sciences, SFEcologie, Oct 2018, Rennes, France.  - 
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17 - 
A. Cavé-Radet, O. Lima, A. Salmon, M. L. Aïnouche, A. E. Amrani - 
Hybridization, polyploidy and tolerance to stressful environments: Investigations to decipher Spartina responses to organic pollutants - 
Réunion du réseau DYNAGEV "Dynamique des Génomes Végétaux" 2016, Jul 2016, Paris, France.  - 
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18 - 
M. L. Aïnouche, A. Baumel, B. Gallego-Tévar, J. Castillo, M. Rousseau-Gueutin, J. Boutte, Julie Ferreira De Carvalho, H. Chelaifa, O. Lima, A. Kovarik, A. Leitch, I. Leitch, A. Ainouche, A. Salmon - 
Unending hybridization and polyploid speciation stories: Lessons from Spartina (Poaceae) - 
XV OPTIMA Meeting, Organization for the Phyto-Taxonomic Investigation of the Mediterranean Area, Jun 2016, Montpellier, France.  - 
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19 - 
A. Salmon, H. Rousseau, J. Boutte, O. Lima, M. Rousseau-Gueutin, J. Wendel, M. L. Aïnouche - 
Détection des homéologues au sein des génomes polyploïdes par capture de séquence : applications chez le cotonnier (Gossypium hirsutum) et les spartines (Spartina sp.) - 
Journée « Capture de gènes » GDR 3692 CNRS-INRA Génomique Environnementale, May 2016, Paris, France.  - 
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Poster

20 - 
M. Rousseau-Gueutin, S. Bellot, G. Martin, J. Boutte, H. Chelaifa, O. Lima, S. Coudouel, D. Naquin, A. Salmon, A. Aïnouche, M. L. Aïnouche - 
The complete chloroplast genome of Spartina maritima: Insights from comparative analyses in the Poaceae family and molecular dating between polyploidy lineages - 
International Conference on Invasive Spartina 2014, Jul 2014, Rennes, France.  - 
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1-20   

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