Séminaire de Zhara AKBARZADEH (University of Waterloo, Canada)


 Olivier Troccaz    27/11/2018 : 10:30

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Le vendredi 30 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 30 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Effects of damming on river nitrogen fluxes: a global analysis

Abstract: Together with phosphorus (P), nitrogen (N) is the major macronutrient limiting or co-limiting the biological productivity of freshwater and marine ecosystems. This study shows that damming significantly changes the fate and transport of N along river networks. Damming creates hotspots of biological activity by promoting the in-reservoir biogeochemical processing of nutrients. Globally, dams eliminate N by burial in sediments accumulating in reservoirs and through the emission of gaseous products of denitrification to the atmosphere. They also increase the N:P ratio of riverine discharge, principally due to in-reservoir N fixation, thereby reducing N limitation of primary production in receiving lentic and coastal marine environments. Damming therefore has important implications for managing the impacts of cultural eutrophication.

Contact: Zhara AKBARZADEH


Soutenance de thèse de Youn HENRY



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Le jeudi 29 novembre 2018 à 13h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le jeudi 29 novembre 2018 à 13h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Influence des facteurs alimentaires et du microbiote intestinal sur la tolérance au stress chez Drosophila melanogaster

Résumé : Un grand nombre de paramètres environnementaux affectent les insectes, et l’identification des éléments impliqués dans l’adaptation aux stress est cruciale. La nutrition est une clé de cette adaptation : elle contrôle la santé des organismes, et par conséquent affecte leur tolérance au stress. Le microbiote intestinal module lui aussi les processus physiologiques des organismes, notamment en agissant sur leur phénotype nutritionnel. Cependant, nous ignorons encore la capacité de ce microbiote à modifier la tolérance au stress de l’hôte.

A travers la manipulation du microbiote et de la nutrition, nous avons testé les effets de l’interaction microbiote-nutrition chez Drosophila melanogaster en nous concentrant sur la tolérance au stress. Nous avons montré une nette dépendance des mouches à l’accès aux levures pour maintenir un développement et un métabolisme normal. A l’inverse, l’altération du développement générée par les substrats nutritionnellement pauvres ou par la surpopulation larvaire était bénéfique pour la tolérance au stress. Nous avons démontré que le microbiote peut partiellement compenser les effets d’une privation en levures, mais n’a pas d’effet quand elles sont en excès. Concernant la thermotolérance, nous avons constaté que les effets du microbiote étaient très variables, et avons attribué cette variabilité à la présence ou l’absence des levures. Les assemblages de microorganismes environnementaux étaient modifiées par la composition du substrat, mais le microbiote intestinal était étonnamment stable. Ces résultats témoignent de la capacité des facteurs nutritionnels et du microbiote à moduler le développement et le phénotype des Drosophiles.

Abstract: A large number of environmental parameters constrain insect species, and identifying the elements involved in the adaptation to stressful conditions is crucial. Nutrition is a key factor of this adaptation: it largely controls health of organisms and therefore their stress tolerance. In addition, it is now established that microbiota (i.e. the whole microbial community associated with a host) is much involved in physiological processes of organisms. In particular, gut microbiota is able to modulate host’s nutritional phenotype, resulting in complex dietary-dependent effects. Whether or not gut microbiota can act on stress tolerance is not clear.

Using experimental manipulation of microbiota and nutrition, we investigated the outcome of the microbiota-nutrition relationship on Drosophila melanogaster, with a special focus on stress tolerance. We showed a clear dependency of flies on yeasts availability to maintain a normal development, metabolism, and size. Conversely, impaired development resulting from artificial poor diets or from larval crowding was often beneficial for stress tolerance. We demonstrated that microbiota could partially compensate for the absence of yeast resource, but no effects were found in rich food contexts. We observed variable importance of microbiota on thermal tolerance, and attributed this variation to the presence or absence of yeasts. Environmental microorganisms communities were modified by diet composition but gut microbiota was surprisingly stable. Together, these findings highlight the importance of nutritional factors and microbiota in developmental and phenotypical plasticity of fruit flies.

Jury :

David RENAULT (Directeur; ECOBIO - Univ. Rennes)
Hervé COLINET (co-Directeur; ECOBIO - Univ. Rennes)
Eric LE BOURG (rapporteur; CRCA - Univ. Toulouse)
Geneviève PREVOST (rapporteuse; EDYSAN - Univ. Amiens)
Patricia GIBERT (examinatrice; LBBE - Univ. Lyon)
Zenobia LEWIS (examinatrice; Univ. Liverpool)
Joan VAN BAAREN (examinatrice; ECOBIO - Univ. Rennes)
Philippe VERNON (examinateur; ECOBIO - Univ. Rennes)

Contact : Youn HENRY


Séminaire de Claire MEROT (Université Laval, Québec, Canada)



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Le mercredi 28 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le mercredi 28 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Quel rôle jouent les variations de structure du génome dans l’adaptation et la spéciation chez la mouche du varech ?

Résumé : Les variations de structure du génome, type inversions chromosomiques, représentent une large part de la diversité intra- et inter-spécifique et, en impactant la recombinaison, sont un facteur-clé de la diversification dans un contexte de flux de gènes. Sur le modèle de la mouche du varech Coelopa frigida, je combine des méthodes expérimentales avec des approches d’écologie, et de génomique des populations afin de mieux comprendre comment forces évolutives et architecture génomique interagissent et comment les variations de structure sont impliquées dans l’adaptation et la diversification.

Je présenterai en particulier le cas d’une inversion chromosomique de grande taille chez Coelopa frigida. Nos résultats suggèrent que cette inversion affecte fortement les traits d’histoire de vie, est impliquée dans l’adaptation locale et présente du polymorphisme dans tout l’Atlantique Nord, maintenu par plusieurs mécanismes de sélection balancée. Nous avons aussi assemblé un génome de référence et, récemment re-séquencé 16 populations le long d’un gradient nord-sud afin de caractériser le paysage génomique de l’inversion dans un contexte adaptatif et démographique. Je parlerai des méthodes utilisées, qui ont permis d’optimiser les coûts de librairies et séquençage, puis des résultats (préliminaires) apportés par l’approche génomique.

Contact : Claire MEROT


Séminaire de Yelitza COLMENAREZ (CABI Latin America)



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Le vendredi 23 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 23 novembre 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Invasive species and its implications on Food Security in Latin America and Caribbean

Abstract: The attack of pests and diseases represent one of the major limitations for agricultural production in the Neotropical region. The intensification of trade between Latin American and Caribbean countries with other regions, among other factors, has resulted in the introduction of a large number of invasive species in the Neotropical region, affecting crop production, putting in risk Food Security and causing a significant economic impact. Despite the efforts to prevent the entry of new pests, through the establishment of quarantine systems, having the implementation of tactics to reinforce phytosanitary surveillance, each year new pests are being introduced in areas where they were not present before. In addition to this, the climate change also represents a challenge for plant protection, since it favours the displacement of pests to new areas due to the increase of temperature and changes in the climatic conditions, facilitating the establishment of the pests. This paper will present the use of key strategies for the sustainable management of pests in the region. Different initiatives to improve the quarantine systems and phytosanitary surveillance will be also presented, highlighting the join efforts and work with key institutions and government agencies of the countries where CABI implements the programs, with the aim of strengthening Food Security and Food Safety in Latin America and the Caribbean.

Contact: Yelitza COLMENAREZ


14ème édition des Rencontres de la Recherche - Fondation Rennes 1



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Le vendredi 16 novembre 2018 à partir de 8h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 16 novembre 2018 à partir de 8h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

14ème édition des Rencontres de la Recherche - Fondation Rennes 1

Voir l'article de la Fondation Rennes 1 consacré à cette journée.

161118 Inscription

Déroulé de la journée :

8h15 Accueil des participants Intervenant(e) Durée
8h30 Accueil Fondation Rennes 1 Sophie Langouët-Prigent, vice-présidente 3mn
  Accueil Jean-François Carpentier VP recherche UR1 5mn
  Présentation de l’Unité ECOBIO Joan Van Baaren, directrice 12mn
8h50 Présentation des projets scientifiques    
  Microbiogie et qualité de l’eau dans les stations d’épuration. Céline Amsaleg 5mn
  Santé des plantes : Approche génomique Abdelhak El Amrani 5mn
 

Rôle des  microorganismes du sol dans l’émission des gaz à effet de serre

Prolifération de  cyanobactéries et défis de gestion

Françoise Binet

Myriam Bormans/Morgane Le Moal

10mn
 

Herbicides et biodiversité des bandes enherbées.

Interactions plantes champignons

Microbiologie et qualité des sols

Cécile Le Lann

Cendrine Mony

Cécile Sulmon-Maisonneuve

15mn
9h30 Visites des 4 plateformes techniques    
  PLAY – Plateforme AnalYtique Hervé Colinet 10mn
  GEH – Génomique Environnementale et Humaine Philippe Vandenkoornhuyse 10mn
  PEM – Plateforme d’Ecologie Moléculaire Pascaline  Le  Gouar 10mn
  ECOLEX – ECOLogie EXpérimentale Cécile Sulmon-Maisonneuve 10mn
10h20 Poursuite des échanges avec les membres de l’Unité dans le pôle serre     30mn
10h50 Fin de l’événement