Séminaire de Claire BAJOU (Plateforme 2PE)


 Olivier Troccaz    30/03/2018 : 16:16

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Le jeudi 5 avril 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le jeudi 5 avril 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Session information appels à projets Européens

La plateforme projets européens, 2PE, vous accompagne dans le développement de votre projet, de l'idée jusqu'à l'acceptation.

2PE est un dispositif mutualisé qui soutient et valorise la participation de la communauté académique bretonne aux programmes européens dédiés à la recherche et l'innovation, Horizon 2020 et ERA-Nets notamment.

Claire BAJOU, Ingénieure projets à la plateforme et référente ECOBIO, vous présentera les opportunités de financements ainsi que les soutiens disponibles en Bretagne, et répondra à vos questions.

Contact : Claire BAJOU

Seminaire 5 Avril 2018


Séminaire de Christophe PENNO (University College Cork)



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Le mardi 3 avril 2018 à 12h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le mardi 3 avril 2018 à 12h30, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Expansion of the genetic information by Programmed Transcriptional Realignment

Productive utilization of RNA polymerase slippage has been selected to enrich gene expression; such slippage involves realignment with respect to its template of the 3’ end of the product RNA and so is known as Programmed Transcriptional Realignment (PTR). The slippage generally occurs at a slippage-prone site and leads to site-specific product RNA heterogeneity involving either addition or omission of bases(s).  Depending on the location of stop codons, standard translation of such transcripts can yield protein products without or with new frame encoded C-terminal amino acids.  

While a counterpart mechanism at the translational is well known to utilize various sites and stimulators, few are known for PTR. It is only in the past 15 years that a few, but important instances of PTR utilization have been discovered. Such cases include the expression of components of the type III secretion system in Shigella flexneri, the causative agent of the human bacillary dysentery. The most common of the limited number of slippage-prone sites known involve homopolymeric runs of A’s or T’s that are adequate on their own to promote PTR.

Our work has identified the first ‘structural’ PTR stimulator. It is an RNA stem-loop structure specified by a retrotransposon gene of the bacteria, Roseiflexus. The accompanying slippage motif is T5C5 motif. In vitro experiments showed that the (prokaryotic) E. coli and (eukaryotic) S. cerevisiae RNA polymerases are stimulated to slip by the RNA stem-loop stimulator when transcribing the T5C5 motif. Our finding has led to computational and experimental testing of PTR gene candidates in various organisms.

Contact : Christophe PENNO

Seminaires 3 Avril 2018


Séminaire de Philippe VANDENKOORNHUYSE


 Olivier Troccaz    28/03/2018 : 14:43

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Le vendredi 30 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 30 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

L’importance du concept d’holobionte : changement de ‘parangon’ et opportunités

Résumé : Les concepts d'holobionte et d'hologénome ont été proposés depuis peu. L'holobionte est composé d'un hôte et des membres stables et transitoires de son microbiome lesquels forment différents types de relations symbiotiques. L'holobionte forme une entité. L'hologénome est composé des génomes des biontes de l'holobionte. Dans une vision holiste, les forces évolutives s'exercent sur l'entité holobionte.
D'ailleurs, de nombreux travaux sur les plantes ont démontré les effets directs et indirects des microorganismes symbiotiques sur la fitness de leur hôte La place de la diversité, des règles d'assemblage et des fonctions de ces symbiotes dans les écosystèmes naturels et agricoles sont des questions d'une importance fondamentale de l'écologie scientifique actuelle et de demain. La transition de la vision plante-centrée vers la vision holobionte aura à évaluer et intégrer les différents niveaux de complexité des interactions. Cette nouvelle vision pourrait ouvrir de nouveaux horizons pour l'agriculture de demain.

Contact : Philippe VANDENKOORNHUYSE

Affiche Seminaire Dynamo 300318


Séminaire de Pavel SASKA (Crop Research Institute, Prague)


 Olivier Troccaz    19/03/2018 : 08:51

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Le vendredi 23 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 23 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Selected chapters from the life history of carabid beetles - parasitoidism, granivory and thermal effects

Carabid beetles (Coleoptera: Carabidae) are one of the dominant and most diverse epigeal groups of arthropods in arable fields and adjacent habitats, where they provide important ecosystem services, including pest regulation and weed seed predation. The presentation will focus on selected aspects of carabid life study that was studied by the presented during the past 20 years. The topic will include: (i) parasitoid life history strategy in the genus Brachinus. The bombardier beetles, are one of the few representatives in Carabidae which develop as parasitoids in the larval stage. The dry-land species develop on pupae of other carabid beetles. The life history of these species will be described. (ii) granivory. Seed feeding is a relatively widespread feeding strategy in Carabidae, being widespread in Harpalini and Zabrini. The preferences for seeds and the importance of seeds in the life cycle of selected species will be reported. (iii) thermal effects on both activity and development. Temperature is the key environmental factor that affects the life of ectothermic organisms. How temperature affects carabid development, their activity in the field and how these effects can be determined and quantified will also be shown.

Contact : Pavel SASKA

Affiche Seminaire Pavel Saska


Séminaire de Françoise LUCAS (LEESU - Laboratoire Eau, Environnement et Systèmes - Université Paris-Est Créteil)



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Le vendredi 9 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Le vendredi 9 mars 2018 à 13h00, salle de conférences de l'OSUR, bâtiment 14b, Campus de Beaulieu, UR1

Diversité microbienne et gestion des eaux urbaines

L’amélioration de la qualité microbiologique des eaux de surface dans les milieux aquatiques urbains (plans d’eau et rivières) présente à la fois un enjeu pour la gestion des ressources en eau et un pour l’amélioration et/ou le maintien du fonctionnement des écosystèmes aquatiques urbains. Une collaboration étroite avec les gestionnaires et l’utilisation de concepts d’écologie microbienne et aquatique est donc la clef de voute pour développer une gestion durable des eaux urbaines. Ainsi au LEESU (université Paris-Est Créteil, ENPC) mes recherches s’orientent d’une manière générale sur l’étude de la dynamique et la diversité des communautés bactériennes aquatiques autour des enjeux de baignade en ville et de réutilisation des eaux usées traitées et des eaux pluviales. A l’aide d’outils moléculaires, de systèmes de mesure en continue et de modèles hydrodynamiques, l’étude de l’impact des changements globaux (usage des sols, micropolluants, évènements pluvieux) sur la dynamique temporelle et la distribution spatiale des communautés bactériennes et des pathogènes d’origine hydrique (mycobactéries et virus entériques) à l’échelle locale et régionale permet de mieux cerner les enjeux sanitaires et écologiques de la gestion des réseaux d’assainissements et des milieux récepteurs.

Contact : Françoise LUCAS

Seminaire  Francoise Lucas 090318