Séminaire ECOBIO de Flore BALLAUD (Equipe RBPE)



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Le vendredi 10 janvier 2014 à 12h45, en salle de conférence de l'OSUR, campus de Beaulieu, bât.

Le vendredi 10 janvier 2014 à 12h45, en salle de conférence de l'OSUR, campus de Beaulieu, bât. 14b, RDC, UR1

Diversité virale et microbienne d’une tourbière à Sphagnum par approche métagénomique

Résumé :
Les tourbières à Sphagnum sont des écosystèmes dont la dynamique spatio-temporelle est caractérisée par un triple gradient abiotique : diminution du pH, de la teneur en eau et de la disponibilité en nutriments. Le rôle des virus dans le contrôle de l’abondance et de la diversité des communautés microbiennes, leur capacité à détourner la boucle microbienne et à modifier le cycle du carbone (C) n’ont, à notre connaissance, jamais été étudiés dans les tourbières. Nous avons caractérisé par une approche ‘omic’, le métagénome et le métavirôme de communautés de fen et de bog, (stades ‘jeune’ et ‘mature’ de la dynamique), à différentes profondeurs et à différentes saisons, dans une tourbière à Sphaignes des Monts du Forez (Puy-de-Dôme). Ces métavirômes sont à notre connaissance les premiers produits pour un sol. L'analyse des métagénômes permet de mieux connaître et distinguer les communautés bactériennes des deux principaux stades de la tourbière, tandis que l'étude des métavirômes a permis d'appréhender la diversité des virus, leur dynamique saisonnière et leur lien avec la communauté bactérienne.

Contact : Flore BALLAUD




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