Axe fédérateur modélisation en écologie

Pourquoi utiliser la modélisation ?

La dynamique de la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes sont des phénomènes complexes. Par la simplification de cette complexité, l’utilisation de la modélisation permet à la fois d’expliquer les mécanismes qui les sous-tendent et de les prédire. Elle permet notamment de dissocier les effets des différents processus dans les propriétés observées et de tester une large gamme de paramètres afin d’identifier les principaux seuils de bascule. Le développement de modèles réalistes permet aussi de prédire des dynamiques futures et/ou l’impact d’un changement, une perturbation par exemple, sur les processus écologiques étudiés. Chacun de ces objectifs – explication ou prédiction des processus– peut nécessiter différents types de modèles et différentes méthodologies pour les construire.

Les principaux objectifs de cet axe

Cet axe fédérateur a pour but de présenter les différentes familles de modèles existantes et de développer des collaborations croisées entre les chercheurs compétents en modélisation présents à ECOBIO et dans d’autres laboratoires rennais et les chercheurs ayant besoin de développer de telles approches théoriques. Il s’agira 1.) d’accompagner la formalisation des questions de recherche en vue du développement d’approches de modélisation ; 2.) de présenter les différentes familles de modèles et 3.) de développer les collaborations entre modélisateurs et écologues expérimentalistes ou de terrain.

 

Les principales familles de modèles abordées

 

Coupler différentes approches de modélisation

Toutes ces méthodes peuvent être par ailleurs couplées, en fonction de la complexité des processus modélisés. Par exemple, des modèles IBM peuvent être couplés à des modèles d’équations différentielles partielles pour simuler la dynamique des assemblages d’espèces en réponse aux conditions environnementales. Des modèles de populations peuvent aussi être basés sur des statistiques fréquentistes ou bayésiennes pour l’estimation des paramètres démographiques et des modèles matriciels de population. En plus de ces différentes méthodes, nous nous attacherons également à développer des techniques transversales telles que des méthodes d’analyses de sensibilité, de validation de modèle ou d’optimisation de paramètres.

 

Liens

Séminaire Introductif

 

Actu

Prochain séminaire : Les équations différentielles, le jeudi 2 février en salle de réunion de l'UFR SVE (bât 13, campus de Beaulieu, UR1) à partir de 9h30

Programme :

9h30  Présentation générale des équations différentielles (Cédric Wolf)

10h  Focus n°1 Modélisation des systèmes environnementaux à base d'EDP (Zahra Thomas)
10h20  Focus n°2 Réaction-Advection-Diffusion dans le paysage (Yoann Bourhis)

10h40 Pausé café

11h  Focus n°3 Temporal niche differentiation of parasites sharing the same plant host: oak powdery mildew as a case study (Frédéric Hamelin)
11h20 Focus n°4 Dynamique du Phytoplancton en rivière (Myriam Bormans)
11h40 Focus n°5 Modélisation de la propagation d’un microparasite dans une population structurée (Cédric Wolf)

12h-12h30: Atelier de discussion