Plateau Technique ECOLEX

La plateforme d’Ecologie Expérimentale (ECOLEX) d’ECOBIO centre ses activités sur le soutien aux expérimentations et observations effectuées au laboratoire (en conditions contrôlées, semi-contrôlées, et ex-situ) ainsi que sur le terrain.
Image accroche ECOLEX

Présentation

La plateforme d’Ecologie Expérimentale (ECOLEX) d’ECOBIO centre ses activités sur le soutien aux expérimentations et observations effectuées au laboratoire (en conditions contrôlées, semi-contrôlées, et ex-situ) ainsi que sur le terrain.

 

Cette plateforme expérimentale repose sur :

- des personnels techniques dont l’implication dans les projets de recherche peut être sollicitée, depuis le développement de protocoles, de dispositifs expérimentaux et de mesures jusqu’à la réalisation des expériences, et qui interviennent également dans la gestion des infrastructures expérimentales

- des infrastructures expérimentales : la plateforme dispose d’infrastructures pour la réalisation d’expérimentations en conditions contrôlées (armoires et chambres climatiques, serre) et semi-contrôlées (jardin expérimental)

- des équipements pour le traitement et stockage d’échantillons : salle de tri, chambres froides, centre optique

 

Les compétences développées par les personnels de la plateforme s’articulent autour de cinq grands axes :

  • Production et expérimentation végétale
  • Maintien et gestion d’espèces d’invertébrés collectées sur le terrain ; expérimentation sur invertébrés
  • Expérimentation et observation des écosystèmes naturels, ruraux et urbains
  • Métrologie
  • Conception et développement de dispositifs expérimentaux

 

Les infrastructures sont regroupées sous forme de 7 pôles techniques

  • Pôle Serre
  • Pôle Jardin Expérimental
  • Pôle Chambres Climatiques
  • Pôle Armoires Phytotroniques
  • Pôle Métrologie
  • Pôle Optique
  • Pôle Conception et Développement

 

La plateforme est animée par un comité de pilotage qui représente les différents pôles techniques, les différentes équipes de recherche de l’UMR ECOBIO et auquel l’ensemble des personnels techniques de la plateforme participe.

Voir la vidéo de présentation

Activités

Les compétences développées par les personnels de la plateforme s’articulent autour de cinq grands axes :

1 - Production et expérimentation végétale

Personnels impliqués : Thierry Fontaine, Fouad Nassur, Rémi Bodiguel

  • Conduite et entretien des cultures en champ, hors sol, sous serres, et, dans certains cas, en chambre climatique
  • Semis et multiplication végétative des espèces, bouturage, greffe, hybridation
  • Réalisation des manipulations élémentaires selon un protocole d’expérimentation
  • Contrôle sanitaire, lutte biologique, et traitements phytosanitaires prescrits
  • Mise en place de dispositifs expérimentaux
  • Montage des systèmes d’arrosage automatique (goutte à goutte, brumisation,…)
  • Entretien et maintenance de premier niveau des installations et du matériel
  • Gestion des déchets végétaux, des solides et des effluents en respectant les règles d’hygiène et de sécurité

 

2 - Maintien et gestion d’espèces d’invertébrés collectées sur le terrain ; expérimentation sur invertébrés

Personnels impliqués : Stéphanie Llopis, Hervé Amat

  • Habilitation à l’expérimentation Animale Niveau II (S Llopis)
  • Maintien et gestion de populations d’invertébrés :
    • Diptères subantarctiques (H Amat, Station Biologique de Paimpont)
    • Insectes (pucerons, blattes, grillons) (H Amat, Station Biologique de Paimpont)
    • Insectes (pucerons et parasitoïdes de pucerons, drosophiles), lombriciens et escargots (S Llopis)
  • Maintien et gestion de populations du lézard Lacerta vivipara (H Amat, Station Biologique de Paimpont)
  • Expérimentations sur invertébrés
    • Pucerons, parasitoides de pucerons, drosophiles, gastéropodes, lombriciens (S Llopis)
    • Diptères subantarctiques (H Amat, Station Biologique de Paimpont)

 

3 -Expérimentation et observation des écosystèmes naturels, ruraux et urbains

Personnels impliqués : Stéphanie Llopis, Valérie Gouesbet, Olivier Jambon, Romain Georges, Guillaume Bouger

Etude des invertébrés

Les travaux portent principamement sur l’entomofaune et les communautés lombriciennes, mais les modèles biologiques abordés peuvent être élargis en fonction des besoins des projets et de la formation des personnels.

  • Conception de plans d’échantillonnage et dispositifs expérimentaux (barbers, pan traps, pièges cornet, suivi de dispersion…) in situ / au laboratoire (R Georges, O Jambon)
  • Coordination des campagnes d’échantillonnages (logistique terrain, gestion des plannings, contacts des intervenants et partenaires, …) (R Georges, O Jambon)
  • Mise en place et suivi de plans d’échantillonnage et dispositifs expérimentaux (barbers, pan traps, pièges cornet, suivi de dispersion…) in situ / au laboratoire (R Georges, O Jambon, S Llopis)
  • Réalisation d’observations, collecte d’échantillons in situ(R Georges, O Jambon, S Llopis)
  • Tri / Identification :
    • Carabes, syrphes, invertébrés subantarctiques (R Georges)
    • Carabes à l’espèce (O Jambon)
    • Pucerons, parasitoïdes de pucerons, syrphes, lombrics (S Llopis)
  • Dissections d’invertébrés (pucerons, parasitoïdes de pucerons : S Llopis)
  • Mesures Morphométriques (entomofaune, lombrics, gastéropodes : S Llopis)
  • Photographies et traitement numérique (Photoshop / ImaJ) (G Bouger, S Llopis)
  • Photogramétie (Photoscan / CloudCompare) : G Bouger
  • Analyse d’échantillons ou préparation d’échantillons pour analyses ultérieures (broyage, préparation pour CHN, teneur en eau, pH, …) (S Llopis)
  • Production de fichiers de données (R Georges)

 

Etude des communautés végétales

  • Coordination des campagnes d’échantillonnages (logistique terrain, gestion des plannings, contacts des intervenants et partenaires, …) (R Georges, O Jambon)
  • Mise en place et entretien de dispositifs expérimentaux

Mésocosmes, bassins, cultures in vitro, microbiologie, … (V Gouesbet)

Sous serres et chambres climatiques (O Jambon)

  • Réalisation d’observations, collecte d’échantillons in situ(R Georges, O Jambon, V Gouesbet)
  • Tri / Identification

Plantes supérieures (O Jambon, V Gouesbet)

Phytoplancton (V Gouesbet)

  • Mesures de traits (O Jambon, V Gouesbet)
  • Analyse d’échantillons ou préparation d’échantillons pour analyses ultérieures (broyage, préparation pour CHN, teneur en eau, pH, …) (V Gouesbet)
  • Photographies
  • Production de fichiers de données (R Georges)

 

4- Métrologie

Personnel impliqué : Guillaume Bouger

Activités développées :

Mise à disposition d’un parc de capteurs (mesure in situ et en laboratoire)

Veille technique et formations pour anticiper les besoins futurs

Gestion et maintenance des instruments

 

Compétences

Bathymétrie, station météo flottante etc.

Aide aux choix des instruments, établissement de cahier des charges, demande de devis

Soutien pour la mise en place des instruments, recueil de données, mise en forme

Transfert de compétences

 

5 -Conception et développement

Personnel impliqué : Jean-Pierre Caudal

 

Activités développées

Développements Electronique – Mécanique – Informatique

 

Compétences

Traduction de la demande des chercheurs pour en élaborer un projet de développement technique

Rédaction du cahier des charges

Proposition de solutions ( CAO )

Etude de la faisabilité - coûts et délais

Réalisation et mise en œuvre

 

 

Les missions des personnels Ecolex leur permettent ainsi d’apporter leur soutien à tout niveau dans les projets de recherche :

Réflexion sur les protocoles expérimentaux

Conception et maintenance des dispositifs et équipements

Production de matériel vivant (espèces végétales et invertébrés)

Pilotage des campagnes d’échantillonnage

Relevés de terrain / Suivi d’expérimentations

Formation des utilisateurs

Équipements

ECOLEX gère et met à la disposition des chercheurs :

Des chambres et armoires climatisées de différentes tailles et dont les conditions (lumière, température,…) sont réglables (box, walk-in chambers, armoires phytotroniques)

2 chambres froides à 4°C (site de Beaulieu)

Des espaces de culture en serre (4 espaces climatisés)

Un jardin expérimental avec platebandes et bassins

Des locaux techniques pour la construction     des dispositifs expérimentaux

Une salle de travail : salle de tri

Un centre optique

 

Afin d’organiser leur suivi et leur maintenance , les infrastructures et les équipements sont regroupés en pôles placés, le plus souvent, sous la responsabilité d’un binôme (1 référent scientifique et 1 référent technique).

  • Pole Serre : Cécile Le Lann / Olivier Jambon
  • Pôle Jardin Expérimental: Cécile Le Lann / Rémi Bodiguel
  • Pôle Chambres Climatiques : Françoise Hennion / Jean-Pierre Caudal
  • Pôle Armoires Phytotroniques : Myriam Bormans / Jean-Pierre Caudal
  • Pôle Métrologie : Guillaume Bouger
  • Pôle Conception et développement : Jean-Pierre Caudal
  • Pôle Optique : Guillaume Bouger

A ces pôles s’ajoutent la salle de tri et les chambres froides qui sont utilisables par tous selon les conditions préconisées par la plateforme (référente : Valérie Gouesbet, site de Beaulieu).


 

Mode de fonctionnement

Demande de participation des personnels aux projets de recherche

Les demandes de soutien des personnels ECOLEX aux projets de recherche devront être formulées suffisamment tôt dans le déroulement des projets de recherche de manière à impliquer les personnels au projet de manière forte et permettre un travail efficace. Il est demandé de :

1° Solliciter, dès le lancement du projet, une rencontre avec le(s) personnel(s) concerné(s) afin de présenter l’étude et définir ensemble leur implication (missions, temps d’investissement, fréquence/période…)

2° Inviter régulièrement les personnels à suivre les avancées du projet (présentations, réunion de travail, répétitions des oraux de stage, …)

Les informations relatives à l’implication des personnels dans les projets de recherche sont disponibles dans le document suivant.

Il est donc impératif de demander un rdv avec les personnels concernés au début des projets.

 

Demande d’utilisation des infrastructures

1 - Les référents de pôles associés aux équipements utilisés vérifieront leur bon état en fin de réservation
2 - Une participation aux frais pourra être demandée pour l’utilisation des infrastructures sous la forme d’achat de matériel que le comité de pilotage estimera utile et justifié au regard de la surface et de la durée d’utilisation des infrastructures.

 


Réservation des salles et équipements spécifiques :

Toute réservation est à faire suffisamment à l'avance pour une meilleure organisation du planning de tous
 

  • Chambres climatiques :

Calendrier d’occupation des chambres

pièce 925
pièce 915 - cellule Conviron
pièce 915 - cellule Eratis


Réservation sur demande auprès de Jean-Pierre CAUDAL

Box d’élevage : sur demande auprès de Joan VAN BAAREN.
 

  • Armoires phytotroniques: réservation libre via les calendriers d’occupation.

Percival invitro
Percival invitrohydro
Percival sol
Percival solaqua
Percival 41L3X/LT
Percival 41L3X
 

  • Serre et Jardin :

Pour l’occupation d’un espace dans la serre, merci d'utiliser les calendriers de réservation consultables via ces liens :

Cellule 1 : 12 m² - 4 tablettes
Cellule 2 : 12 m² - 4 tablettes
Cellule 3 : 24 m² - 8 tablettes
Cellule 4 : OGM - 12 m² - 2 tablettes

Le plages de réservations sont validées par Olivier JAMBON. En cas de problème, l'utilisateur est contacté.

Pour l’utilisation d’espaces de cultures ou d’expérimentations extérieures: sur demande auprès de Rémi BODIGUEL
 

  • Centre Optique

Réservation libre via les calendriers d’occupation

 

  • Salle de tri

Réservation libre via les calendriers d’occupation

 

  • Matériel de métrologie

Sur demande auprès de Guillaume BOUGER

 

  • Utilisation de l’outillage du LED (Labo d’Etudes et Développement)

Sur demande auprès de Jean-Pierre CAUDAL

 

  • Utilisation des chambres Froide à 4°C de Beaulieu

Les contenants doivent être placés dans des caisses plastiques, fermées et identifiées, à disposition auprès de Valérie GOUESBET.

Comité de Pilotage

C. SULMON ECOLEX (responsable scientifique)
J-P. CAUDAL ECOLEX (référent technique)
H. AMAT ECOLEX
R. BODIGUEL ECOLEX
G. BOUGER ECOLEX
T. FONTAINE ECOLEX
R. GEORGES ECOLEX
V. GOUESBET ECOLEX
O. JAMBON ECOLEX
S. LLOPIS ECOLEX
F. NASSUR ECOLEX
A. PANNARD Représentant équipe DYNAMO
F. CABELLO-HURTADO Représentant équipe EGA
C. LE LANN Représentant équipe ESDD
A. ERNOULT / C. MONY Représentants équipe PAYSACLIM
C. SULMON Représentant équipe PHENOME
C. MONARD/M. BORMANS Représentant équipe RITME
F. HENNION Référent sc. Chambres climatiques
C. LE LANN Référent sc. Serres et jardin
M. BORMANS Référent sc. Armoires Phytotroniques

Membres