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Équipements


Plateau technique localisé sur le campus de Beaulieu

  • Extractions ADN/ARN

Paillasses, Pipettes, Vortex, Centrifugeuses, Thermoblocs, Agitateurs rotatifs

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  • Caractérisation des acides nucléiques

Cuves d’électrophorèse, e-gels, salle BET, Nanodrop, Biopuces

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  • PCR et PCRq

Thermocycleurs (4 Mastercycler, 96 puits), Thermocycleur Roche LC480 (96 ou 384 puits)

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  • Cytométrie

Cytomètre Accuri C6

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  • Préparation d’échantillons

Bead-Beating (broyeur) et Robot pipeteur EpMotion 5075 pour réorganisation d’échantillons

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  • Infrastructure commune

Stockage froid 4°C et -20°C et -80°C, azote liquide

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Centrifugeuses, Ultracentrifugeuse

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Hotte chimique, PSM (poste de sécurité microbiologique)

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Eau milliQ et eau déminéralisée

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Autoclave

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Logiciel de lecture de chromatogrammes GeneMapper sur poste du centre

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Plateau technique localisé à la station Biologique de Paimpont Technique de la « marche en avant » pour « ADN dégradé »

  • Salle d’extraction d’ADN

Hotte

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Une centrifugeuse à plaques

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Une centrifugeuse 24 tubes 2ml

 

Etuve muni d’un mélangeur rotatif

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Deux vortex & une broyeuse à glace

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Un agitateur magnétique thermo-régulé

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3 jeux de pipettes

  • Salle de PCR

Trois thermocycleurs

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  • Salle des gels

Une cuve électrophorèse verticale

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Deux cuves horizontales

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Un système DGGE

Un imageur avec logiciel de lecture des gels

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Un four micro-ondes

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  • Salle de stockages froid

Trois congélateurs -80°

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Trois congélateurs -20°

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et 2 réfrigérateurs 4°C

  • Phases post PCR

Les analyses de fragments d’ADN et le séquençage sont réalisés sur d’autres sites, soit, en collaboration, sur le séquenceur de l’IGDR (campus Villejean) soit pour le séquençage Haut Débit à la plateforme de génomique environnementale sur le campus de Beaulieu.

Les lectures de chromatogrammes sont réalisées à Paimpont avec le logiciel GeneMapper sur un poste dédié.

Lectures de chromatogrammes sur GeneMapper

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